Il-prinċipju tad-diżinfezzjoni tal-ipoklorit tas-sodju jinkludi prinċipalment tliet aspetti:
L-aċidu ipokloruż huwa ffurmat permezz ta 'idroliżi, u l-aċidu ipokloruż jkompli jiddekomponi biex jifforma ossiġnu ekoloġiku ġdid. Il-proprjetà ossidanti qawwija ta 'ossiġnu ekoloġiku ġdid jiddenatura sustanzi bħal proteini fuq batterji u viruses, u b'hekk joqtol mikro-organiżmi patoġeniċi.
L-aċidu ipokloruż jista 'jippenetra fil-batterji (viruses) u jirreaġixxi ma' polimeri organiċi bħal proteini batteriċi (virali), aċidi nuklejċi u enzimi, u b'hekk joqtol mikro-organiżmi patoġeniċi.
Il-joni tal-klorur prodotti mill-aċidu ipokloruż jistgħu jibdlu b'mod sinifikanti l-pressjoni osmotika tal-batterji u l-viruses, u jikkawżaw li ċ-ċelloli tagħhom jitilfu l-attività u jmutu.